马上注册,结交更多好友,享用更多功能,让你轻松玩转社区。
您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册
x
本帖最后由 青菜567 于 2023-9-28 10:41 编辑 * X9 W0 @; K# ]) P5 ?
' d0 R* O. F2 T3 p
无论就医看病还是体检,做的检查除了仪器检查如B超、CT、核磁共振、胃肠镜外,最多的就是生化检查,如基于血液、尿液、大便、痰液等的检测,因为这些体液中含有众多生物标志物,能够提供关于健康状况和疾病风险的重要信息。
H1 Q+ f( z: w
: T9 E6 I. F! I
以血液为例,血液是流动在人的血管和心脏中的一种红色不透明的粘稠液体,负责各类营养物质的输送以及机体产生的废物的排除。血液由血浆和血细胞组成。血浆中含有水、蛋白质和其他溶解物质,血细胞包括红细胞、白细胞和血小板。 7 o% W6 |/ r8 q. `$ Y/ q; S: T A
血液中一些指标的异常时常预示着身体某个器官或组织机能受损。目前基于血液的肿瘤早筛技术中经常提到的cfDNA就是血浆中存在的一种分子标志物。 f0 {) X, R8 K$ ~( i4 I$ u
(参考于网络图片)
5 h1 j8 C& g- R5 m, w
: Z2 y2 {5 V# k' g如何理解cfDNA和ctDNA?
+ A6 }* J8 k# f( t2 bcfDNA全称为cell free DNA即细胞游离DNA,顾名思义就是指游离于细胞外的DNA。那么问题来了,DNA不都是在细胞内吗,怎么会跑到细胞外呢? - K$ Y7 n _2 Q0 j
人体内的细胞不断更新换代,也就是说每天每时每刻我们体内都不断地有细胞在凋亡,又有新的细胞在形成。在细胞凋亡过程中有些DNA会“破壳而出”进入血液中,另外,人体在外界物理或化学刺激下引发的细胞坏死也会导致DNA释放到血液中,所以我们人体血液中都含有cfDNA。 T- M4 K( x* u% o" m
(参考于网络图片)
- `+ q9 ^6 F3 Z但对于肿瘤患者来说,其血液中除了含有正常细胞凋亡或坏死释放的DNA外,还包括肿瘤细胞释放的DNA,这部分DNA有个专有名称叫ctDNA,全称为circulating tumor DNA即循环肿瘤DNA。因此对于肿瘤患者来说,血液中的cfDNA包含了ctDNA。 : u, m% g" b* Y* Z
ctDNA主要来源于坏死的肿瘤细胞、凋亡的肿瘤细胞、循环肿瘤细胞(CTC)、肿瘤细胞分泌的外排体,其携带与肿瘤发生相关的分子信号,这些分子信号如同肿瘤的“身份指纹”,对肿瘤早筛、肿瘤精准治疗都具有非常重要的意义。
+ ^) r3 W3 m" [9 |4 i. _9 zcfDNA全基因组测序肿瘤早筛技术
) c3 Z; m) G/ r
通过上面我们了解了cfDNA和ctDNA的概念和区别,那么对于肿瘤早筛来说,到底检测的是cfDNA上的哪些信息?也就是哪些信息是与肿瘤的早期发生相关呢?这个需要经过临床研究进行标志物的筛选和验证。 5 `# Z& e$ L- u7 T3 ~: q8 k6 W
和瑞基因研发团队通过临床研究发现,仅需受检者10ml静脉血,通过全基因组测序技术(WGS, Whole Genome Sequencing)和自主研发的机器学习算法,在全基因组范围内分析四个维度的特征提取及模型构建,包括末端序列、片段大小分布、核小体印迹、拷贝数变异,可精准评估六大高发高危癌种风险,包括肺癌及五大消化系统癌种(食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结直肠癌),并可准确溯源癌症风险器官。 7 K' c( L# v, R: X: C
那么如何理解四个维度呢? 9 Q0 E7 o: L- R. n# r$ u5 b7 x
片段大小
( @3 K' @) D5 b4 u& `/ f
( \/ {/ J' m' D' S0 EDNA片段大小以核苷酸碱基对的数量表示,以bp为单位。肿瘤细胞释放的ctDNA片段大小比正常细胞释放的cfDNA更短。
% }/ G- t$ Q; ~6 P+ l# Y( m 末端序列
1 e! E9 x* X5 U, w1 _6 C& d U5 Z' M在DNA片段化进入血液过程中,DNA发生了非随机断裂,其末端的几个核苷酸,癌与非癌具有不同偏好的末端切割模式。6 j3 n, p+ b/ v4 p' J+ w( M
0 j1 p/ ]( P9 g- W
核小体印迹9 R; K4 ~8 m5 l, z& G% G
: F6 N2 ~( l) p- {6 m9 K
肿瘤发生和发展的内因是原癌基因的活化和/或抑癌基因的失活等异常表达,而核小体印迹的松散程度可代表基因表达活跃程度的高低。
0 ]8 F% E( l! N$ E/ x 拷贝数变异
2 g3 O: u+ c+ l; j! k9 C! j/ Y# V$ y, @6 y2 f
肿瘤组织通常存在拷贝数变异等染色体异常现象,而正常组织基本无此现象。 3 Y$ f) P ~' B( E
(可点击图片放大查看) - 5 h/ k+ o# E" ?* V' n3 M( r
. R. C* M' S6 |* T5 p- R7 P: X8 z- p# |: a5 j7 w
|